biodata

📚 Приглашаем на новую встречу ololo BOOK CLUB, которую мы организуем совместно с магазином Janmates (https://www.janmates.com/)! 📚

В этот раз наш гость — Станислав Скакун, ИТ-предприниматель, энтузиаст радикального продления жизни и биохакер. Мы обсудим две знаковые книги в области биогеронтологии: «Отменить старение» Обри ди Грея и «Заменить старение» Жана Эбера.

💡 Как наука и биотехнологии могут повлиять на борьбу со старением? Какие подходы и теории изложены в этих книгах? На встрече мы поговорим о технических методах борьбы с возрастными изменениями, научной обоснованности этих подходов и их связи с реальными достижениями в биотехнологиях. Эта дискуссия откроет вам перспективы в области продления жизни и роли науки в будущем.

Если вам интересны стратегии борьбы со старением, не пропустите!

🌟 ololo BOOK CLUB проходит при поддержке книжного магазина Janmates (https://www.janmates.com/). На встречах вас ждут приятные подарки, а также скидка 10% на книги и другие товары магазина по промокоду «ololo». 🌟

📅 Дата: 13 марта, четверг
🕕 Время: 18:30
📍 Место: ololoPlanet, (ул. Юнусалиева, 80)
🎟 Вход свободный при регисстрации

Сидели с Иваном Моргуновым и обсуждали кейс Дейва Паско (Dave Pascoe) (https://vk.com/video-229018404_456239048) американского биохакера 62 лет.

Мы не покупаем фотки обмазанного маслом Дейва из бани, поэтому разбирались основательно, и не во всем мы поддержали Дейва, но любом случае он попадает в наш watch-list и будем отслеживать его успехи.

У нас остались вопросы, и в любом случае, чего за глаза кости промывать) Отправил приглашение, зададим ему наши вопросы, если придет к нам на стрим.

Для всех, у кого сегодняшние новости вызывают фрустрацию, предлагаем простое решение.

Новое исследование, опубликованное в журнале Microbiom (https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-024-01961-3) (n = 32 427 участников), показывает, что употребление хотя бы одного апельсина в день снижает риск депрессии. Поиски механизма показали, что употребление цитрусовых вызывает рост 15 видов бактерий, но в их числе и резидентного штамма бактерий Faecalibacterium prausnitzii.

Также показана, связь более низкой численности вида F. prausnitzii и его метаболитов-кофакторов S-аденозил-L-метионин (SAM) цикла у участников с депрессией. Причинно-следственная связь, судя по всему, в том что более низкая продукция SAM этими бактериями F. prausnitzii может снизить экспрессию гена кишечной моноаминоксидазы A, в свою очередь участвующего в синтезе серотонина и дофамина.

Короче, всем по апельсинке в день и хорошее настроение вернется (depression relative risk = 0.78).

И вот пока разбирался, прочитал, что в эти же дни произошел релиз модели EVO-2 (https://arcinstitute.org/news/blog/evo2) (о возможностях первой версии, которая вышла в начале 2024 года вы можете почитать тут (https://www.together.ai/blog/evo)).

Это семейство моделей в отличие от AlphaFold и BioEmu предназначено для более низкоуровневой задачи: проектирование последовательности нуклеотидов ДНК, с которых может быть в том числе считан нужный вам белок. Натренированная на последовательностях ДНК из более чем 9 трлн. нуклеотидов (это ДНК более 128 000 видов, вошедших в датасет для обучения) EVO-2 способна проектировать целые геномы с промоутерами, интронами и прочими элементами.

Этот релиз принципиально замыкает весь спектр задач по моделированию новых дизайнерских (полностью синтетических, не существовавших в природе) генов, которые в том числе могут применяться для достижения пренебрежимой скорости старения.

Тем не менее, с учетом скорости проведения "мокрых" экспериментов, до получения годного результата на человеке остаются десятилетия.

В процессе поиска обсудил это с Grok 3 Deep Research (https://grok.com/share/bGVnYWN5_7b731251-c550-4c06-b649-a273e1742022), у которого тоже периодически кипел мозг.

Тут важное событие (https://www.microsoft.com/en-us/research/blog/exploring-the-structural-changes-driving-protein-function-with-bioemu-1/): Microsoft присоединилась к гонке по вычислению протеинов, опубликовав в открытом доступе свою модель Biomolecular Emulator-1 (BioEmu-1). И сразу залидировала в гонке, если правильно понимаю, решив важнейшую задачу моделирования динамического поведения белков.

Как раньше отмечалось, уже известная нам модель AlphaFold версий 1-2-3 решает задачу воссоздания наиболее вероятной статической структуры белка по его аминокислотной последовательности. Однако в ходе модификаций в течение своего жизненного цикла белок неоднократно меняет форму и следовательно, функцию. Этот аспект посттрансляционных модификаций упущен в моделировании AlphaFold, а точнее, правильно сказать, не входит в ее задачи. И вот именно поиск этого многообразия форм решен BioEmu-1. Как описано в публикации, для решения этой задачи BioEmu-1 обучили на трех наборах данных, каждый из которых придал конечной модели отдельные важные свойства, а уже их синергия обеспечила решение:

(1) База данных AlphaFold (AFDB) (https://alphafold.com/) (обеспечивает выделение диапазона возможных структур);

(2) набора данных моделирования молекулярной динамики (это данные о динамических модификациях белков, полученные как прямым наблюдением в микроскопах, так и описания физико-математическими моделями); этот датасет позволил предсказывать физически правдоподобные структурные изменения, отображая множество возможных структур, которые может принять один белок;

(3) экспериментального набора данных стабильности сворачивания белка (https://www.nature.com/articles/s41586-023-06328-6) (позволяет выбирать свернутые и развернутые структуры с правильными вероятностями).

Оказывается, принципиальный препринт (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.05.626885v1) этого результата вышел еще в декабре, но я его проглядел. Да и эту ссылку мне прислал подписчик. Спасибо ему)

Надо продолжать читать обзоры по этой публикации и вникать дальше, но еще раз, если правильно понимаю, то решена именно та проблема, за которую скептики ругали AlphaFold.

Заметили косяк в моем изложении? Отпишитесь в комментах, давайте обсудим)

Всем спасибо за участие! к сожалению запись видео пока не появилась, и это может означать, что имел место сбой записи, т.к. обычно tldv предоставляет запись в течение 10 минут после окончания встречи. Ну штош, это издержки прямого эфира.

Поэтому оставлю тут слайды (https://docs.google.com/presentation/d/1_wZZpnsD3mylnzAG3fhQQf6t3yIzQYC7U8T05dsGUiE/edit?usp=sharing), которые не содержат ответов на вопросы, но возможно по крайней мере будут полезны тем, кто был на встрече.

Напишите в комментариях, что было бы хорошо улучшить в формате (кроме того что запись должна работать 🤪).

Следующий стрим проведем примерно через месяц, сделаем доклад про измерение биовозраста и есть ли в нем какой-то смысл, и снова возьмем все вопросы, у кого они будут. И так далее пойдем по всем актуальным темам биохакинга.

Итак, поскольку большинству удобно 23.02 14:00 МСК мы проведем наш первый стрим про биохакинг в это время.

В повестке небольшое интро и ввод в тему от меням и дальше ваши вопросы.

В этот раз используем Google meets, запись будет от tldv.io

Cтримим про биохакинг - Ep 01
Sunday 23 Feb · 14:00 – 15:00 MSK
Google Meet joining info: https://meet.google.com/hvi-jmoh-ryt

Благодаря прекрасной Елене Сухановой (https://t.me/hellenhappy_channel) мы оперативно располагаем записью моего доклада "Откуда придет победа над старением?" (https://vk.com/video-196205589_456239017) для конференции Древо Жизни, и можем им поделиться вместе со слайдами (https://drive.google.com/file/d/11yGkorub2s0Wpo2sKHincKLoYO-6saEM/view?usp=drive_link).

на связи (https://t.me/+oHwlVMn2WS81ZTQy)

Время моего доклада переехало на 12:30, 16 февраля (в воскресение) и (вроде) окончательно установилось. Это Малый зал. Поговорим о том, почему мы думаем, что имеем шансы победить старение. Вопрос непраздный, все-таки 100+ миллиардов человек умерло за всю историю человечества (https://www.weforum.org/stories/2022/04/quantifying-human-existence/), и у них почему-то не получилось, хотя они тоже хотели.

Если вы рассчитывали на утро, не беспокойтесь, со всеми, с кем хотели увидеться, все равно сможем увидеться, я оба полных дня буду на конференции, а слайды будут потом тут)

на связи (https://t.me/+oHwlVMn2WS81ZTQy)

📅 15–16 февраля в Москве пройдет конференция "Древо жизни"

Учёные и предприниматели соберутся, чтобы ответить на главные вопросы:

🔬 Где сейчас наука в понимании механизмов старения?
🚀 Можем ли мы повлиять на его замедление и обращение?
🏛 Что должны делать государство, бизнес и общество, чтобы ускорить прогресс?

🔹 Что в программе:
✅ Панельные дискуссии с лидерами биотеха, нейронаук, генетики и клеточной медицины.
✅ Практические мастер-классы.
✅ Презентации передовых разработок и технологий.
✅ Нетворкинг с игроками индустрии.

Мой доклад состоится утром 16.02.

🎟 Промокод LONGEVITY20 даёт -20% на билет!
📍 Программа и регистрация: treeoflife-conf.ru

на связи (https://t.me/+oHwlVMn2WS81ZTQy)

Связь людей - истинная сила. А связи формируются в том числе на мероприятиях, и поэтому ловите список крупных мероприятий в отрасли Longevity 2025 года (https://docs.google.com/spreadsheets/d/12No0fw_f2ca7AmSxLOteFf_yJ-vU2lfoyk-5zcq8hkA/edit?gid=0 =0) по всему миру, который мы курируем для нашего сообщества предпринимателей. Если вы захотите добавить известные вам мероприятия, оставьте комментарий к посту, или напишите мне в тг на .

Что за сообщество: летом 2024 года совместно с еще 4 предпринимателями я основал сообщество предпринимателей за радикальное продление жизни. Рабочее название LessDead, мы находимся в полу-stealth режиме и набираем участников.

Что делаем полезного: объединяем предпринимателей в направлении Longevity, потому что победа в конечном итоге придет не от государства, не от ученых, и не от инопланетян, а от прорывных инженерных проектов, подобных 23me, Altos Labs, компаний из портфеля Apollo Health или OS Fund, и подобных им стартапов.

Денег не даем) но можем помочь сориентироваться в ландшафте технологий и найти нужные контакты.

Участие в сообществе бесплатное, но есть правила)

1) Вы должны быть предпринимателем в области longevity или искать вход в эту отрасль.

2) Вы должны поддерживать идею радикального продления жизни (цель — превышение текущего максимума в 120 лет).

3) Псевдонаука и ложные заявления не допускаются. Сложные случаи должны быть подтверждены публикациями или разбираются экспертным советом.

4) Принимаются только продукт-ориентированные предприниматели (например, допускаются IT, wet-biotech, deep tech и т.д., а инфобизнес и консалтинговые модели не принимаются).

5) Недобросовестная конкуренция (разглашение конфиденциальной информации, инсайдерская торговля, взятки и т.д.) запрещена.

По всем вопросам: в тг на

на связи (https://t.me/+oHwlVMn2WS81ZTQy)