Akatsuki

Yagura, teoria accreditata da Ao il quale fu lo scopritore (grazie al Byakugan impiantato) di un genjutsu ai danni del Quarto Mizukage. Durante i grandi conflitti fra i cinque villaggi ninja, l'Akatsuki, in quanto composta da mercenari, ha aiutato diversi villaggi tra cui quello della Roccia contro il Villaggio della Nuvola. Una volta fondata l'organizzazione, Madara affidò il ruolo di leader a Nagato, e rimase nell'ombra nelle vesti di Tobi. All'Akatsuki, in seguito, si aggregarono diversi personaggi, ognuno con le proprie capacità: Deidara, Sasori, Itachi, Kisame, Zetsu, Konan, Orochimaru, Sasuke e il suo Team. Dopo la cattura di sette delle forze portanti, Madara ordina a Nagato e Konan di attaccare il Villaggio della Foglia per impossessarsi della Volpe a Nove Code ed al Team Taka di catturare l'Hachibi. Dopo i rispettivi insuccessi, Madara si presenta alla riunione del Summit dei Kage, insieme a Sasuke, al Team Taka e Zetsu, e, dopo una dura battaglia, annuncia l'inizio della Quarta Guerra Ninja.